×
تعداد دانشجو
۲۰۹ نفر
۱۹,۰۰۰ تومان ۱۱,۴۰۰ تومان

آموزش آشنایی با نرم افزار Cytoscape برای ترسیم و آنالیز انواع شبکه

آموزش آشنایی با نرم افزار Cytoscape برای ترسیم و آنالیز انواع شبکه

تعداد دانشجو
۲۰۹ نفر
مدت زمان
۵۸ دقیقه
هزینه عادی آموزش
۱۹,۰۰۰ تومان
در طرح تخفیف
۱۱,۴۰۰ تومان

(کسب اطلاعات بیشتر +)
۱ بازخورد (مشاهده نظرات)
آموزش آشنایی با نرم افزار Cytoscape برای ترسیم و آنالیز انواع شبکه

چکیده

نرم افزار سایتواسکیپ (Cytoscape) یک ابزار متن باز و رایگان برای ترسیم و آنالیز شبکه ها است. این نرم افزار محبوبیت زیادی دارد و مقاله های زیادی به آن استناد کرده اند. علاوه بر امکانات موجود در این نرم افزار، افزونه های (Plugins) زیادی هم برای آن موجود است. بیشترین کاربرد سایتواسکیپ در حوزه بیوانفورماتیک و تحلیل شبکه های اجتماعی است. از شبکه های معروف در حوزه بیوانفورماتیک می توان به: شبکه های تعامل پروتئین – پروتئین (PPI)، شبکه بیان ژن، شبکه متابولیکی و شبکه فیلوژنی اشاره کرد.

مدرس
فرشید شیرافکن

دانشجوی دکتری تخصصی بیوانفورماتیک

مهندس فرشید شیرافکن دارای مدرک کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر گرایش نرم افزار بوده و در حال حاضر دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران هستند. ایشان از مدرسین نمونه در زمینه ارائه و آموزش دروس دانشگاهی انتخاب شده اند.

چکیده آموزش


توضیحات تکمیلی

نرم افزار سایتواسکیپ (Cytoscape) یک ابزار متن باز و رایگان برای ترسیم و آنالیز شبکه ها است. این نرم افزار محبوبیت زیادی دارد و مقاله های زیادی به آن استناد کرده اند. علاوه بر امکانات موجود در این نرم افزار، افزونه های (Plugins) زیادی هم برای آن موجود است.

برای بررسی شبکه، داده ها باید به صورت گراف مدل شوند. گراف مجموعه ای از راس ها و یال ها است که گره ها واحدهای تشکیل دهنده شبکه و یال ها ارتباطات بین این واحدها را مشخص می کنند. برای تعیین اهمیت راس ها از معیارهای مرکزیت استفاده می شود.

بیشترین کاربرد سایتواسکیپ در حوزه بیوانفورماتیک و تحلیل شبکه های اجتماعی است. از شبکه های معروف در حوزه بیوانفورماتیک می توان به: شبکه های تعامل پروتئین – پروتئین (PPI)، شبکه بیان ژن، شبکه متابولیکی و شبکه فیلوژنی اشاره کرد.

 

فهرست سرفصل ها و رئوس مطالب مطرح شده در این مجموعه آموزشی، در ادامه آمده است:
  • درس یکم: دانلود و نصب نرم افزار، ایجاد شبکه
    • دانلود و نصب سایتواسکیپ
    • ایجاد شبکه از طریق فایل های CSV
    • ایجاد شبکه از طریق فایل های txt
    • ایجاد شبکه در محیط سایتواسکیپ
  • درس دوم: جستجو، منوی View و Select
    • جستجو در شبکه بر اساس نام گره
    • جستجو به کمک * , ?
    • معرفی منوی View و Select
    • انتخاب مجموعه ای از گره ها و یال ها به روش های مختلف
  • درس سوم: ایجاد Style
    • ایجاد Style جدید برای گره ها
    • ایجاد Style جدید برای یال ها
  • درس چهارم: ایجاد فیلتر، منوی Layout و Apps
    • انتخاب به کمک ایجاد فیلترها
    • ایجاد زنجیره ای از فیلترها
    • تعیین گره های متصل شده با یال های انتخابی
    • ایجاد Annotation
    • معرفی منوی Layout
    • معرفی منوی Apps

 

مفید برای رشته های
  • مهندسی کامپیوتر - نرم افزار
  • بیوانفورماتیک
  • زیست شناسی
مشاهده بیشتر مشاهده کمتر

نرم افزارهای مرتبط با آموزش

Cytoscape



پیش نمایش‌ها

۱. دانلود و نصب نرم افزار، ایجاد شبکه

توجه: اگر به خاطر سرعت اینترنت، کیفیت نمایش پایین‌تر از کیفیت HD ویدئو اصلی باشد؛ می‌توانید ویدئو را دانلود و مشاهده کنید (دانلود پیش‌نمایش - حجم: ۶ مگابایت -- (کلیک کنید +))

۲. جستجو، منوی View و Select

توجه: اگر به خاطر سرعت اینترنت، کیفیت نمایش پایین‌تر از کیفیت HD ویدئو اصلی باشد؛ می‌توانید ویدئو را دانلود و مشاهده کنید (دانلود پیش‌نمایش - حجم: ۱۹ مگابایت -- (کلیک کنید +))

۳. ایجاد Style
مشاهده این پیش‌نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.
۴. ایجاد فیلتر، منوی Layout و Apps
مشاهده این پیش‌نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.

راهنمای سفارش آموزش‌ها

آیا می دانید که تهیه یک آموزش از فرادرس و شروع یادگیری چقدر ساده است؟

(راهنمایی بیشتر +)

در مورد این آموزش یا نحوه تهیه آن سوالی دارید؟
  • با شماره تلفن واحد مخاطبین ۵۷۹۱۶۰۰۰ (پیش شماره ۰۲۱) تماس بگیرید. - تمام ساعات اداری
  • با ما مکاتبه ایمیلی داشته باشید (این لینک). - میانگین زمان پاسخ دهی: ۳۰ دقیقه


اطلاعات تکمیلی

نام آموزش آموزش آشنایی با نرم افزار Cytoscape برای ترسیم و آنالیز انواع شبکه
ناشر فرادرس
شناسه اثر ۸–۱۲۴۵۲–۰۷۵۲۴۶ (ثبت شده در مرکز رسانه‌های دیجیتال وزارت ارشاد)
کد آموزش FVSFT128
مدت زمان ۵۸ دقیقه
زبان فارسی
نوع آموزش آموزش ویدیویی (لینک دانلود)
حجم دانلود ۱۳۳ مگابایت (کیفیت ویدئو HD‌ با فشرده سازی انحصاری فرادرس)

آموزش‌های پیشنهادی برای شما

نظرات

تا کنون ۲۰۹ نفر از این آموزش استفاده کرده اند و ۱ نظر ثبت شده است.
فرشید شیرافکن - مدرس
فرشید شیرافکن - مدرس

سلام- پیشنهاد مدرس آموزش:
مخاطبین عزیز این آموزش، آموزش گراف کاوی و تحلیل شبکه ها در پایتون با NetworkX را ببینید.


برچسب‌ها:
Annotation | Cytoscape | cytoscape- node | Edge | Layout | Network | Network Analysis | Network Drawing | Plugins | PPI | ppi سایتواسکیپ | Styles | آموزش سایتواسکیپ | ادغام شبکه ها | ایجاد شبکه ها | بیوانفورماتیک | تجزیه و تحلیل شبکه ها | تحلیل شبکه های اجتماعی | ترسیم و آنالیز شبکه | حاشیه نویسی شبکه ها | رسم و آنالیز شبکه | سبک ها | شبکه | شبکه بیان ژن | شبکه پروتئین پروتئین | شبکه فیلوژنی | شبکه متابولیکی | شبکه های تعامل پروتئین – پروتئین | شبکه های تودرتو | طرح بندی | فایل های CSV | فایل های txt | فرمت های فایل | فیلتر کردن شبکه | گره | لایه بندی | محیط Cytoscape | محیط سایتواسکیپ | مدیریت برنامه های کاربردی | منوی Apps | منوی Layout | منوی View و Select | نرم افزار Cytoscape | نرم افزار سایتواسکیپ | وارد کردن جدول داده | یال
مشاهده بیشتر مشاهده کمتر