برای تکثیر هر قطعه دلخواهی از ژنوم، یک جفت پرایمر اختصاصی مورد نیاز است. این پرایمرها باید طوری طراحی شوند که از طرفی کاملا مکمل توالی هدف باشند و از سوی دیگر به هیچ بخش دیگری از مولکول الگو، متصل نشوند. این عامل به همراه چند عامل دیگر، طراحی پرایمر را به مرحله ای دقیق و حساس از روند کلون سازی ژن ها تبدیل می نماید. با توجه به اهمیت این مرحله در روند کلی فرایند کلونینگ، در این فرادرس در نظر داریم با معرفی نرم افزار اولیگو (Oligo)، مخاطبان را با روند کلی طراحی پرایمر و برخی ریزه کاری های آن آشنا سازیم.
آموزش طراحی پرایمر با نرم افزار الیگو Oligo
دکتر عاطفه شریفی راد دکترای ژنتیک مولکولی از پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری هستند که در حال حاضر علاوه بر مشاوره پایان نامه دانشجویان در این مرکز، با برخی از سازمان های فعال در زمینه ژنتیک نیز در انجام برخی طرح های پژوهشی، همکاری دارند.
توضیحات تکمیلی
دست ورزی های ژنتیکی، ابزاری قدرتمند در اختیار ژنتیک دانان قرار می دهد تا مولکول های هدف را برای رسیدن به اهداف گوناگون، ویرایش کرده و ویژگی های جدیدی را به آن ها اضافه نمایند. لازمه گام برداشتن در این مسیر، مطالعات بیوانفورماتیکی قوی است که با کمک نرم افزارهای مختلف، امکان پذیر است.
به عنوان مثال، برای تکثیر هر قطعه دلخواهی از ژنوم، یک جفت پرایمر اختصاصی مورد نیاز است. این پرایمرها باید طوری طراحی شوند که از طرفی کاملا مکمل توالی هدف باشند و از سوی دیگر به هیچ بخش دیگری از مولکول الگو، متصل نشوند. این عامل به همراه چند عامل دیگر، طراحی پرایمر را به مرحله ای دقیق و حساس از روند کلون سازی ژن ها تبدیل می نماید.
با توجه به اهمیت این مرحله در روند کلی فرایند کلونینگ، در این فرادرس در نظر داریم با معرفی نرم افزار اولیگو (Oligo)، مخاطبان را با روند کلی طراحی پرایمر و برخی ریزه کاری های آن آشنا سازیم.
فهرست سرفصل‌ها و رئوس مطالب مطرح شده در اين مجموعه آموزشی، در ادامه آمده است:
- درس یکم: مقدمات طراحی پرایمر
- معرفی محیط نرم افزار اولیگو (Oligo)
- وارد کردن توالی مورد نظر و بررسی اولیه آن
- درس دوم: طراحی پرایمرها
- جستجو برای یک جفت پرایمر اولیه
- آنالیز پرایمرها
- ویرایش طول و توالی پرایمر
- ویژگی های ساختاری
- ویژگی های اتصالی
- واکنش PCR
- درس سوم: آنالیز پرایمرها در NCBI
مفید برای
- زیست شناسی
- مهندسی کشاورزی
پیش نیاز
آنچه در این آموزش خواهید دید:
نرم افزارهای مرتبط با آموزش
راهنمای سفارش آموزش‌ها
.svg)
در مورد این آموزش یا نحوه تهیه آن سوالی دارید؟
- با شماره تلفن واحد مخاطبین ۵۷۹۱۶۰۰۰ (پیش شماره ۰۲۱) تماس بگیرید. - تمام ساعات اداری
- با ما مکاتبه ایمیلی داشته باشید (این لینک). - میانگین زمان پاسخ دهی: ۳۰ دقیقه
اطلاعات تکمیلی
| نام آموزش | آموزش طراحی پرایمر با نرم افزار الیگو Oligo |
|---|---|
| ناشر | فرادرس |
| شناسه اثر | ۸–۱۲۴۵۲–۰۶۹۲۹۲ (ثبت شده در مرکز رسانه‌های دیجیتال وزارت ارشاد) |
| کد آموزش | FVGA97102 |
| مدت زمان | ۱ ساعت و ۳۹ دقیقه |
| زبان | فارسی |
| نوع آموزش | آموزش ویدئویی (نمایش آنلاین + دانلود) |
| حجم دانلود | ۱۸۳ مگابایت (کیفیت ویدئو HD با فشرده سازی انحصاری فرادرس) |
- ۱۰۰ درصد مبلغ پرداختی در حساب کاربری شما شارژ می‌شود.
- و یا ۷۰ درصد مبلغ پرداختی به حساب بانکی شما بازگشت داده می‌شود.
نظرات
استاد فن بیان خوبی دارند خیلی دوسشون دارم
سلام. خیلی ممنون از خانم دکتر بابت تدریس خوبشون. امروز خریدم همین امروز هم دیدم و یاد گرفتم.
خیلی خوب بود. مرسی.
مختصر و بسیار مفید و کاربردی بود. ممنون.
سلام، آموزش خوبی بود ممنونم
با توجه به این آموزش کارم راه افتاد واقعا عالی بود با اینکه در این مورد خیلی آشنایی نداشتم.
خیلی خوب بود من بدون اینکه کلاس بیرون برم کامل تونستم طراحی کنم.
برای دوره کارشناسی کامله، اما برای کسی که ارشد می خونه قطعا تعداد مثال ها کمه.
مربوط به کار آزمایشگام هست که گرفتمش، به نظرم خوبه. استادم با نرم افزارهای دیگه کار می کردن ولی من با الیگو کار کردم و خوب یاد گرفتم، البته خیلی فرقی هم نداشتن.
سلام . با عرض خسته نباشین بابت افزایش سطح اموزشی و عملی دانشجویان . این اموزش بسیار کاربری و راحت بیان شده بود. که برای رشته های بیوتکنولوژی و ژنتیک بسیار کاربردی است. علاوه بر الان به نکات مهمی در طراحی پرایمر نیز اشاره شده بود. دانشجویان کارشناسی حتما قبل از ورود به ارشد از این اموزش ها استفاده کنند