Faradars Discount
x عدم نمایش ۴۰٪ تخفیف تخفیف ویژه هفته کتاب و کتابخوانی کد تخفیف: ABAN98 .
Faradars Discount
فرصت باقیمانده

آموزش نرم افزار VMD برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

دسترسی به اطلاعات این آموزش: اطلاعات کلی محتوا و سرفصل ها پیش نمایش و دانلود اطلاعات تکمیلی دیدگاه ها
آموزش نرم افزار VMD برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

درباره ناشر

فرادرس
فرادرس

فرادرس بزرگ‌ترین ناشر دیجیتال آموزش‌های تخصصی، دانشگاهی و مهندسی است.

درباره مدرس

نسیم رسافر
نسیم رسافر

مدرس فرادرس

کارشناسی ارشد زیست شناسی


نسیم رسافر در حال حاضر به عنوان محقق و پژوهشگر در حوزه طراحی داروهای ضدسرطانی در مرکز تحقیقات علوم پایه دانشگاه تبریز مشغول به فعالیت هستند. (+)



از اواخر دهه ۱۹۹۰، زیست شناسی محاسباتی تبدیل به بخش مهمی از فناوری های در حال رشد در زیست شناسی شده است. شبیه سازی دینامیکی مولکولی، تکنیکی است که شما با استفاده از آن می توانید به طور موثری ارتباط بین ساختار و عملکرد ماکرومولکول ها (Macromolecule) را درک کنید. (Visual Molecular Dynamics (VMD نرم افزاری است که برای مدل سازی، نمایش و تجزیه و تحلیل سیستم های بیولوژیکی، مانند: پروتئین ها، اسیدهای نوکلئیک، لیپیدها و… طراحی شده است. آموزش این نرم افزار شما را قادر خواهد ساخت تا طیف گسترده ای از مدل های نمایش و رنگ آمیزی مولکول را مشاهده کنید و همچنین می توانید برای تجزیه و تحلیل یک مسیر شبیه سازی دینامیک مولکولی از آن استفاده کنید.

👤 مدرس: نسیم رسافر
🕓 مدت زمان: ۲ ساعت و ۱۶ دقیقه
🎓 تعداد دانشجو: ۷۹ نفر این آموزش را تهیه کرده اند. — ۱۷ نفر در یک ماه اخیر
روش دریافت: صرفا از طریق لینک دانلود (بدون بسته فیزیکی)

هزینه آموزش: ۱۸,۰۰۰ تومان


آنچه شما در این فرادرس خواهید دید:
آموزش ویدئویی مورد تایید فرادرس
فایل برنامه ها و پروژه های اجرا شده در حین آموزش
فایل PDF یادداشت های مدرس در حین آموزش

تضمین کیفیت و گارانتی بازگشت هزینه
توجه: کیفیت این آموزش توسط فرادرس تضمین شده است. در صورت عدم رضایت از آموزش، به انتخاب شما:
  • به صورت رایگان یک یا چند آموزش معادل دیگر دریافت می کنید.
  • و یا ۷۰ درصد مبلغ پرداختی به حساب بانکی شما بازگشت داده می شود.
    (توضیحات بیشتر +)
دانلود آنی
فعال‌سازی آنی لینک دانلود، بلافاصله پس از ثبت سفارش


    توضیحات

    چکیده آموزش


    از اواخر دهه ۱۹۹۰، زیست شناسی محاسباتی تبدیل به بخش مهمی از فناوری های در حال رشد در زیست شناسی شده است. شبیه سازی دینامیکی مولکولی، تکنیکی است که شما با استفاده از آن می توانید به طور موثری ارتباط بین ساختار و عملکرد ماکرومولکول ها (Macromolecule) را درک کنید.

    مطالعه ساختار ماکرومولکول ها، نقطه عطف در زیست شناسی به شمار می رود. قوانین مولکولی مبتنی بر ساختار، منجر به درک پدیده های بیولوژیکی پایه، مانند: مکانیزم های آنزیمی، نقل و انتقالات غشایی و ایجاد ساختارهای بزرگی مانند: ریبوزوم ها، کپسیدهای (Capsid) ویروسی و همچنین چگونگی کنترل رونویسی و ترجمه DNA می شود. خروجی شبیه سازی، روند تغییرات سیستم در طی زمان مورد نظر است که با استفاده از معادلات حرکت نیوتن و توابع انرژی پتانسیل به دست می آید.

    (Visual Molecular Dynamics (VMD نرم افزاری است که برای مدل سازی، نمایش و تجزیه و تحلیل سیستم های بیولوژیکی، مانند: پروتئین ها، اسیدهای نوکلئیک، لیپیدها و… طراحی شده است. آموزش این نرم افزار شما را قادر خواهد ساخت تا طیف گسترده ای از مدل های نمایش و رنگ آمیزی مولکول را مشاهده کنید و همچنین می توانید برای تجزیه و تحلیل یک مسیر شبیه سازی دینامیک مولکولی از آن استفاده کنید.

     

    ویژگی های کلیدی نرم افزار VMD عبارتند از:

    • نمایش سه بعدی مولکول در مدل ها و رنگ آمیزی های متفاوت
    • انتخاب زیرمجموعه ای از اتم ها برای نمایش
    • پشتیبانی از اکثر فرمت ها
    • پشتیبانی از تعداد نامحدود اتم ها، مولکول ها یا فریم های مسیر شبیه سازی
    • قابلیت تهیه تصاویر با وضوح بالا
    • قابلیت ساخت فیلم
    • ساخت و تهیه سیستم های شبیه سازی دینامیک مولکولی

     

    فهرست سرفصل ها و رئوس مطالب مطرح شده در این مجموعه آموزشی، در ادامه آمده است:
    • درس یکم: کار با یک مولکول
      • معرفی نرم افزار Visual Molecular Dynamics یا VMD
      • دانلود و نصب نرم افزار VMD
      • اجرای نرم افزار VMD
      • بارگیری مولکول
      • تنظیمات نمایشگر موس
      • نمایش گرافیکی مولکول
      • مدل های مختلف نمایش مولکول
      • مدل های مختلف رنگ آمیزی مولکول
      • مواد
      • نمایش گزینشی سیستم
      • ایجاد نمایش های گزینشی مختلف
      • ذخیره عملیات
    • درس دوم: تهیه عکس
      • تنظیمات صفحه نمایش
      • تنظیمات رنگ
      • تنظیمات مواد
      • برچسب گذاری
      • ذخیره عکس
    • درس سوم: تهیه فیلم
      • بارگیری فایل مسیریابی
      • تنظیمات نمایش فریم ها
      • تنظیمات گرافیک اجزای سیستم
      • تنظیمات نمایش گزینشی سیستم
      • تنظیمات نمایش مسیر شبیه سازی
      • ذخیره فایل مسیریابی با دو فرمت MPG و WMV
    • درس چهارم: کار با چند مولکول
      • بارگیری مولکول ها
      • تعیین مولکول پیش فرض
      • فعال کردن و غیرفعال کردن مولکول
      • نمایش و مخفی کردن یک مولکول در صفحه نمایش
      • ثابت کردن مولکول
      • تغییر نام مولکول ها
      • حذف مولکول ها
      • انتخاب گرافیک متفاوت برای هر مولکول
    • درس پنجم: آنالیز
      • نمایش توالی پروتئین
      • الاین (Align) ساختار مولکول ها با MULTI – seq
      • محاسبه QH ,RMSD و PI
      • رنگ آمیزی مولکول ها براساس تشابه ساختاری
      • الاین توالی چند مولکول با MULTI – seq
      • رنگ آمیزی مولکول ها براساس تشابه توالی
      • الاین توالی چند مولکول با فرمت FASTA
      • درخت فیلوژنتیک (Phylogenetic tree)
      • RMSD

     

    مفید برای رشته های
    • مهندسی کشاورزی
    • داروسازی
    • زیست شناسی

    نرم افزارهای مرتبط با آموزش

    VMD 1.9.2

    پیش نیاز

    پیش نمایش

    پیش نمایش ۱ : کار با یک مولکول - ۱۰ دقیقه


    توجه: ممکن است که به خاطر سرعت پایین اینترنت شما، نمایش آنلاین با کیفیت پایین تر از کیفیت HD ویدئوی اصلی نمایش داده شوند. در این صورت آموزش را دانلود کرده و سپس مشاهده نمایید.

    دانلود مستقیم پیش نمایش - حجم دانلود ۱۹ مگابایت (کلیک کنید +)


    پیش نمایش ۲ : تهیه عکس - ۷ دقیقه


    توجه: ممکن است که به خاطر سرعت پایین اینترنت شما، نمایش آنلاین با کیفیت پایین تر از کیفیت HD ویدئوی اصلی نمایش داده شوند. در این صورت آموزش را دانلود کرده و سپس مشاهده نمایید.

    دانلود مستقیم پیش نمایش - حجم دانلود ۱۳ مگابایت (کلیک کنید +)


    پیش نمایش ۳ : تهیه فیلم - ۷ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.

    پیش نمایش ۴ : کار با چند مولکول - ۳ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.

    پیش نمایش ۵ : آنالیز - ۶ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.


    آموزش‌های پیشنهادی و مرتبط




    اطلاعات تکمیلی

    نام آموزش آموزش نرم افزار VMD برای شبیه سازی دینامیک مولکولی
    ناشر فرادرس
    شناسه اثر ۸-۱۲۴۵۲-۰۷۱۴۶۲ (ثبت شده در مرکز رسانه‌های دیجیتال وزارت ارشاد)
    کد آموزش FVBIO9704
    مدت زمان ۲ ساعت و ۱۶ دقیقه
    زبان فارسی
    نوع آموزش آموزش ویدئویی     (کیفیت HD - مورد تایید فنی فرادرس)
    حجم دانلود ۴۹۰ مگابایت     (کیفیت ویدئو HD‌ با فشرده سازی انحصاری فرادرس)


    ​راهنمای تهیه آموزش ها

    آیا می دانید که تهیه یک آموزش از فرادرس و شروع یادگیری چقدر ساده است؟

    راهنمایی بیشتر ( +)

    در مورد این آموزش یا نحوه تهیه آن سوالی دارید؟ 
    • با شماره تلفن واحد مخاطبین ۵۷۹۱۶۰۰۰ (پیش شماره ۰۲۱) تماس بگیرید. - تمام ساعات اداری
    • با ما مکاتبه ایمیلی داشته باشید (این لینک). - میانگین زمان پاسخ دهی: ۳۰ دقیقه

    با شروع یادگیری، یک کلیک فاصله دارید. همین حالا شروع کنید.

    آموزش نرم افزار VMD برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

    هزینه آموزش: ۱۸,۰۰۰ تومان




    دیدگاه ها

    تا کنون ۷۹ نفراز این آموزش استفاده کرده اند.

    نظر شما در مورد این فرادرس چیست؟

    پاسخ دهید

    نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

    امتیاز شما به این آموزش:



​همین امروز شروع به آموختن کنید​

آموزش نرم افزار VMD برای شبیه سازی دینامیک مولکولی

هزینه آموزش: ۱۸,۰۰۰ تومان


برچسب‌ها: , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,

دسته های مرتبط: ,


فرادرس در رسانه ها و جشنواره ها

روزنامه ایرانیان مرکز توسعه فناوری اطلاعات و رسانه های دیجیتال روز آفرین نت استارت کنفرانس مهندسی برق ایران جشنواره وب ایران