Faradars Discount
x عدم نمایش ۵۰٪ تخفیف بزرگترین تخفیف سال ۹۸ ویژه روز دانشجو کد تخفیف: AZAR98 .
Faradars Discount
فرصت باقیمانده

آموزش آنالیز داده های متاژنوم با نرم افزارهای بیوانفورماتیک

دسترسی به اطلاعات این آموزش: اطلاعات کلی محتوا و سرفصل ها پیش نمایش و دانلود اطلاعات تکمیلی دیدگاه ها
آموزش آنالیز داده های متاژنوم با نرم افزارهای بیوانفورماتیک

درباره ناشر

فرادرس
فرادرس

فرادرس بزرگ‌ترین ناشر دیجیتال آموزش‌های تخصصی، دانشگاهی و مهندسی است.

درباره مدرس

مهندس محمدحسین نوروزی بیرامی
مهندس محمدحسین نوروزی بیرامی

مدرس فرادرس

دانشجوی دکترای تخصصی بیوانفورماتیک


محمدحسین نوروزی بیرامی دانشجوی دکترای بیوانفورماتیک دانشگاه تهران و در حال انجام رساله دکتری در حوزه متاژنوم و ارتباط آن با بیماری‌ های مختلف از جمله سرطان نیز هستند، همچنین ۱۰ سال سابقه هیات علمی در دانشگاه آزاد اسلامی را دارند و مربی پایه ۷ می باشند. (+)



امروزه بیوانفورماتیک به عنوان یک حوزه بین رشته ای در بین دانشمندان حوزه زیست شناسی و سلامت، اهمیتی انکار ناپذیر دارد. در کشور ما نیز از سال ها قبل این رشته تاسیس و مورد توجه قرار گرفته است ولی گسترش و کاربرد آن در حد مطلوبی نیست. در این آموزش می خواهیم با آموزش عملی، دانشجویان را برای ورود به این حوزه مهم و کاربردی ترغیب نماییم. در این آموزش می خواهیم نحوه کار با داده های متاژنوم را به صورت عملی و کاربردی به مخاطب آموزش دهیم. اکثر افرادی که از این محتوا استفاده خواهند کرد، عموما غیرکامپیوتری هستند و آموزش قدم به قدم و ساده بسیار باب میل آن ها خواهد بود.

👤 مدرس: مهندس محمدحسین نوروزی بیرامی
🕓 مدت زمان: ۳ ساعت و ۲۳ دقیقه
🎓 تعداد دانشجو: ۵۶ نفر این آموزش را تهیه کرده اند. — ۲۹ نفر در یک ماه اخیر

هزینه آموزش: ۳۰,۰۰۰ تومان


آنچه شما در این فرادرس خواهید دید:
آموزش ویدئویی مورد تایید فرادرس
فایل برنامه ها و پروژه های اجرا شده در حین آموزش
فایل PDF یادداشت های مدرس در حین آموزش

تضمین کیفیت و گارانتی بازگشت هزینه
توجه: کیفیت این آموزش توسط فرادرس تضمین شده است. در صورت عدم رضایت از آموزش، به انتخاب شما:
  • به صورت رایگان یک یا چند آموزش معادل دیگر دریافت می کنید.
  • و یا ۷۰ درصد مبلغ پرداختی به حساب بانکی شما بازگشت داده می شود.
    (توضیحات بیشتر +)
دانلود آنی
فعال‌سازی آنی لینک دانلود، بلافاصله پس از ثبت سفارش


    توضیحات

    چکیده آموزش


    امروزه بیوانفورماتیک به عنوان یک حوزه بین رشته ای در بین دانشمندان حوزه زیست شناسی و سلامت، اهمیتی انکارناپذیر دارد. در کشور ما نیز از سال ها قبل، این رشته تاسیس شده و مورد توجه قرار گرفته است ولی گسترش و کاربرد آن در حد مطلوبی نیست. در این آموزش می خواهیم با آموزش عملی، دانشجویان را برای ورود به این حوزه مهم و کاربردی ترغیب نماییم.

    اکثر نرم افزارهای موجود در این حوزه به صورت Open Source و تحت لینوکس است. از طرف دیگر، آموزش این نرم افزارها و کار با آن ها برای دانشجویان کار سختی است. به این دلیل بعضی از دانشجویان در رشته های مختلف از ورود به این حوزه می ترسند. این آموزش به صورت ساده، روان و تصویری مراحل انجام کارهای مختلف و همچنین نرم افزارهای موجود را توضیح می دهد. همچنین برای این کارها حداقل ده نرم افزار مستقل وجود دارد که پیدا کردن و یادگیری آن ها ممکن است در توان همه نباشد.

    در این آموزش می خواهیم نحوه کار با داده های متاژنوم را به صورت عملی و کاربردی به مخاطب آموزش دهیم. اکثر افرادی که از این محتوا استفاده خواهند کرد، عموما غیرکامپیوتری هستند و آموزش قدم به قدم و ساده بسیار باب میل آن ها خواهد بود.

     

    فهرست سرفصل ها و رئوس مطالب مطرح شده در این مجموعه آموزشی، در ادامه آمده است:
    • درس یکم: پیش پردازش و کنترل کیفی داده های متاژنوم
      • بررسی و تبدیل داده ها به فرمت استاندارد
      • کنترل کیفی داده ها با استفاده از نرم افزار FastQC
      • استخراج اطلاعات آماری داده ها
      • ارائه مثال با استفاده از نرم افزار محلی و سرور Galaxy
    • درس دوم: استخراج میکروارگانیسم های موجود در توالی های متاژنوم
      • استفاده از نرم افزار MetaPlAn برای مشخص کردن فراوانی باکتریایی موجود در هر نمونه
      • نصب نرم افزار MetaPlAn و اجرای آن بر روی کامپیوتر شخصی و سرور Galaxy
    • درس سوم: استخراج اطلاعات براساس نگاشت توالی
      • معرفی کاتالوگ های ژنی مناسب
      • پیش پردازش اولیه بر روی کاتالوگ ژنی
      • نگاشت توالی های نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار Mosaik به کاتالوگ نوکلئوتیدی
      • استخراج اطلاعات براساس نرم افزارهای SAMtools
      • نگاشت توالی های نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار BLAST – NCBI به کاتالوگ های پروتئینی
      • اجرای نگاشت ها به صورت محلی و بر روی سرورهای Galaxy
    • درس چهارم: استخراج اطلاعات براساس اسمبلی توالی‌ ها
      • معرفی نرم افزارهای اسمبلی توالی های متاژنوم
      • اسمبلی داده های متاژنوم با استفاده از نرم افزار MetaVelvet و تولید کانتیگ های بزرگ تر
      • استفاده از نرم افزار مبتنی بر وب MetaGeneMark برای پیش گویی ژن های موجود در توالی ها
      • به دست آوردن توالی های نوکلئوتیدی و پروتئینی برای ژن های پیش گویی شده
      • حذف ژن های تکراری با نرم افزار CD-HIT
    • درس پنجم: استخراج اطلاعات تفسیرشده از پایگاه داده KEGG
      • استخراج گروه های ارتولوگ براساس توالی ژنی (KO)
      • استخراج گروه های آنزیمی براساس KO ها
      • استخراج واکنش های مرتبط با آنزیم ها

     

    مفید برای رشته های
    • بیوتکنولوژی
    • زیست شناسی


    پیش نیاز

    پیش نمایش

    پیش نمایش ۱ : پیش ‌پردازش و کنترل‌ کیفی داده ‌های متاژنوم - ۶ دقیقه


    توجه: ممکن است که به خاطر سرعت پایین اینترنت شما، نمایش آنلاین با کیفیت پایین تر از کیفیت HD ویدئوی اصلی نمایش داده شوند. در این صورت آموزش را دانلود کرده و سپس مشاهده نمایید.

    دانلود مستقیم پیش نمایش - حجم دانلود ۶ مگابایت (کلیک کنید +)


    پیش نمایش ۲ : استخراج میکروارگانیسم‌ های موجود در توالی‌ های متاژنوم - ۶ دقیقه


    توجه: ممکن است که به خاطر سرعت پایین اینترنت شما، نمایش آنلاین با کیفیت پایین تر از کیفیت HD ویدئوی اصلی نمایش داده شوند. در این صورت آموزش را دانلود کرده و سپس مشاهده نمایید.

    دانلود مستقیم پیش نمایش - حجم دانلود ۷ مگابایت (کلیک کنید +)


    پیش نمایش ۳ : کاتالوگ ژنی - ۲ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.

    پیش نمایش ۴ : متاژنوم - ۹ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.

    پیش نمایش ۵ : استخراج اطلاعات تفسیرشده از پایگاه ‌داده KEGG - ۹ دقیقه


    مشاهده آنلاین و یا دانلود رایگان این پیش نمایش، نیازمند عضویت و ورود به سایت (+) است.


    آموزش‌های پیشنهادی و مرتبط




    اطلاعات تکمیلی

    نام آموزش آموزش آنالیز داده های متاژنوم با نرم افزارهای بیوانفورماتیک
    ناشر فرادرس
    کد آموزش FVBIO9801
    مدت زمان ۳ ساعت و ۲۳ دقیقه
    زبان فارسی
    نوع آموزش آموزش ویدئویی     (کیفیت HD - مورد تایید فنی فرادرس)
    حجم دانلود ۶۵۷ مگابایت     (کیفیت ویدئو HD‌ با فشرده سازی انحصاری فرادرس)


    ​راهنمای تهیه آموزش ها

    آیا می دانید که تهیه یک آموزش از فرادرس و شروع یادگیری چقدر ساده است؟

    راهنمایی بیشتر ( +)

    در مورد این آموزش یا نحوه تهیه آن سوالی دارید؟ 
    • با شماره تلفن واحد مخاطبین ۵۷۹۱۶۰۰۰ (پیش شماره ۰۲۱) تماس بگیرید. - تمام ساعات اداری
    • با ما مکاتبه ایمیلی داشته باشید (این لینک). - میانگین زمان پاسخ دهی: ۳۰ دقیقه

    با شروع یادگیری، یک کلیک فاصله دارید. همین حالا شروع کنید.

    آموزش آنالیز داده های متاژنوم با نرم افزارهای بیوانفورماتیک

    هزینه آموزش: ۳۰,۰۰۰ تومان




    دیدگاه ها

    تا کنون ۵۶ نفراز این آموزش استفاده کرده اند.

    نظر شما در مورد این فرادرس چیست؟

    پاسخ دهید

    نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

    امتیاز شما به این آموزش:



​همین امروز شروع به آموختن کنید​

آموزش آنالیز داده های متاژنوم با نرم افزارهای بیوانفورماتیک

هزینه آموزش: ۳۰,۰۰۰ تومان


برچسب‌ها: , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , , ,

دسته های مرتبط:


فرادرس در رسانه ها و جشنواره ها

روزنامه ایرانیان مرکز توسعه فناوری اطلاعات و رسانه های دیجیتال روز آفرین نت استارت کنفرانس مهندسی برق ایران جشنواره وب ایران